Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms