Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
NMD3Q96D46 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
NMD3Q96D46 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NMD3Q96D46 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NMD3Q96D46 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NMD3Q96D46 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NMD3Q96D46 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NMD3Q96D46 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NMD3Q96D46 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NMD3Q96D46 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NMD3Q96D46 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NMD3Q96D46 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NMD3Q96D46 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NMD3Q96D46 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NMD3Q96D46 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NMD3Q96D46 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NMD3Q96D46 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NMD3Q96D46 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NMD3Q96D46 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NMD3Q96D46 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NMD3Q96D46 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NMD3Q96D46 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NMD3Q96D46 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NMD3Q96D46 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NMD3Q96D46 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NMD3Q96D46 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NMD3Q96D46 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NMD3Q96D46 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NMD3Q96D46 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NMD3Q96D46 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NMD3Q96D46 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NMD3Q96D46 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NMD3Q96D46 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NMD3Q96D46 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NMD3Q96D46 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NMD3Q96D46 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NMD3Q96D46 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NMD3Q96D46 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NMD3Q96D46 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NMD3Q96D46 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NMD3Q96D46 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NMD3Q96D46 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NMD3Q96D46 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NMD3Q96D46 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NMD3Q96D46 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NMD3Q96D46 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NMD3Q96D46 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NMD3Q96D46 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NMD3Q96D46 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NMD3Q96D46 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NMD3Q96D46 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NMD3Q96D46 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NMD3Q96D46 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NMD3Q96D46 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NMD3Q96D46 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NMD3Q96D46 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NMD3Q96D46 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NMD3Q96D46 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NMD3Q96D46 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NMD3Q96D46 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NMD3Q96D46 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NMD3Q96D46 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NMD3Q96D46 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NMD3Q96D46 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NMD3Q96D46 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NMD3Q96D46 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NMD3Q96D46 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NMD3Q96D46 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NMD3Q96D46 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NMD3Q96D46 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NMD3Q96D46 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NMD3Q96D46 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NMD3Q96D46 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NMD3Q96D46 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NMD3Q96D46 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NMD3Q96D46 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms