Protein–RNA interactions for Protein: Q96A61

TRIM52, Tripartite motif-containing protein 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM52Q96A61 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TRIM52Q96A61 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TRIM52Q96A61 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TRIM52Q96A61 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
TRIM52Q96A61 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TRIM52Q96A61 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TRIM52Q96A61 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TRIM52Q96A61 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TRIM52Q96A61 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRIM52Q96A61 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRIM52Q96A61 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRIM52Q96A61 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRIM52Q96A61 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRIM52Q96A61 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRIM52Q96A61 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRIM52Q96A61 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRIM52Q96A61 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRIM52Q96A61 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
TRIM52Q96A61 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRIM52Q96A61 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
TRIM52Q96A61 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRIM52Q96A61 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
TRIM52Q96A61 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRIM52Q96A61 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRIM52Q96A61 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRIM52Q96A61 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRIM52Q96A61 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRIM52Q96A61 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRIM52Q96A61 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRIM52Q96A61 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRIM52Q96A61 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRIM52Q96A61 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRIM52Q96A61 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRIM52Q96A61 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
TRIM52Q96A61 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRIM52Q96A61 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRIM52Q96A61 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRIM52Q96A61 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRIM52Q96A61 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRIM52Q96A61 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRIM52Q96A61 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRIM52Q96A61 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRIM52Q96A61 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRIM52Q96A61 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRIM52Q96A61 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRIM52Q96A61 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRIM52Q96A61 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRIM52Q96A61 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRIM52Q96A61 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRIM52Q96A61 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRIM52Q96A61 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRIM52Q96A61 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRIM52Q96A61 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRIM52Q96A61 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRIM52Q96A61 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRIM52Q96A61 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRIM52Q96A61 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
TRIM52Q96A61 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRIM52Q96A61 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRIM52Q96A61 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRIM52Q96A61 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRIM52Q96A61 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRIM52Q96A61 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRIM52Q96A61 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRIM52Q96A61 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRIM52Q96A61 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
TRIM52Q96A61 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
TRIM52Q96A61 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRIM52Q96A61 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRIM52Q96A61 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRIM52Q96A61 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRIM52Q96A61 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
TRIM52Q96A61 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
TRIM52Q96A61 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
TRIM52Q96A61 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
TRIM52Q96A61 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRIM52Q96A61 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRIM52Q96A61 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRIM52Q96A61 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRIM52Q96A61 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRIM52Q96A61 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRIM52Q96A61 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRIM52Q96A61 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRIM52Q96A61 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRIM52Q96A61 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRIM52Q96A61 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRIM52Q96A61 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRIM52Q96A61 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRIM52Q96A61 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRIM52Q96A61 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
TRIM52Q96A61 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRIM52Q96A61 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRIM52Q96A61 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRIM52Q96A61 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRIM52Q96A61 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRIM52Q96A61 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRIM52Q96A61 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRIM52Q96A61 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRIM52Q96A61 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRIM52Q96A61 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms