Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF3

SSMEM1, Serine-rich single-pass membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSMEM1Q8WWF3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSMEM1Q8WWF3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms