Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBB5

KLHDC4, Kelch domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC4Q8TBB5 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms