Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC63Q8NA47 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC63Q8NA47 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC63Q8NA47 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC63Q8NA47 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC63Q8NA47 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC63Q8NA47 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC63Q8NA47 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC63Q8NA47 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC63Q8NA47 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC63Q8NA47 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC63Q8NA47 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC63Q8NA47 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC63Q8NA47 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC63Q8NA47 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC63Q8NA47 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC63Q8NA47 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC63Q8NA47 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC63Q8NA47 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC63Q8NA47 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC63Q8NA47 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC63Q8NA47 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC63Q8NA47 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC63Q8NA47 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC63Q8NA47 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC63Q8NA47 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC63Q8NA47 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC63Q8NA47 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC63Q8NA47 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC63Q8NA47 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC63Q8NA47 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC63Q8NA47 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC63Q8NA47 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC63Q8NA47 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC63Q8NA47 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC63Q8NA47 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC63Q8NA47 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC63Q8NA47 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC63Q8NA47 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC63Q8NA47 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC63Q8NA47 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC63Q8NA47 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC63Q8NA47 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC63Q8NA47 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC63Q8NA47 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC63Q8NA47 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC63Q8NA47 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC63Q8NA47 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC63Q8NA47 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC63Q8NA47 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC63Q8NA47 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC63Q8NA47 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC63Q8NA47 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC63Q8NA47 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC63Q8NA47 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC63Q8NA47 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC63Q8NA47 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC63Q8NA47 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC63Q8NA47 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC63Q8NA47 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC63Q8NA47 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC63Q8NA47 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC63Q8NA47 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC63Q8NA47 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC63Q8NA47 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC63Q8NA47 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC63Q8NA47 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC63Q8NA47 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms