Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVB4

SLC9A9, Sodium/hydrogen exchanger 9, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A9Q8IVB4 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC9A9Q8IVB4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC9A9Q8IVB4 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC9A9Q8IVB4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC9A9Q8IVB4 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC9A9Q8IVB4 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC9A9Q8IVB4 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC9A9Q8IVB4 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC9A9Q8IVB4 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms