Protein–RNA interactions for Protein: Q7KZF4

SND1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SND1Q7KZF4 COL9A3-203ENST00000462700 1237 ntTSL 319.49■□□□□ 0.714e-20■■■□□ 15
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SND1Q7KZF4 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.621e-13■■■□□ 15
SND1Q7KZF4 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.51e-13■■■□□ 15
SND1Q7KZF4 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.21e-13■■■□□ 15
SND1Q7KZF4 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.081e-13■■■□□ 15
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SND1Q7KZF4 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.864e-7■■■□□ 15
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SND1Q7KZF4 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.664e-7■■■□□ 15
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SND1Q7KZF4 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.254e-7■■■□□ 15
SND1Q7KZF4 LY6E-215ENST00000523847 427 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.324e-7■■■□□ 15
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SND1Q7KZF4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.921e-13■■■□□ 15
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SND1Q7KZF4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.081e-13■■■□□ 15
SND1Q7KZF4 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.871e-13■■■□□ 15
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SND1Q7KZF4 CES2-203ENST00000561697 918 ntTSL 315.84■□□□□ 0.133e-10■■■□□ 15
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SND1Q7KZF4 APOL1-212ENST00000475519 600 ntTSL 410.02□□□□□ -0.813e-10■■■□□ 15
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SND1Q7KZF4 CTSA-208ENST00000485627 695 ntTSL 39.95□□□□□ -0.821e-7■■■□□ 15
SND1Q7KZF4 ATF5-204ENST00000597227 828 ntTSL 317.05■□□□□ 0.324e-11■■■□□ 15
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SND1Q7KZF4 ETV6-204ENST00000544715 733 ntTSL 317.45■□□□□ 0.383e-7■■■□□ 15
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SND1Q7KZF4 PSMD1-208ENST00000467792 444 ntTSL 26.3□□□□□ -1.43e-7■■■□□ 15
SND1Q7KZF4 APLP2-205ENST00000461918 553 ntTSL 35.62□□□□□ -1.512e-13■■■□□ 15
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SND1Q7KZF4 RABAC1-205ENST00000599219 799 ntTSL 218.51■□□□□ 0.554e-7■■■□□ 15
SND1Q7KZF4 APOL1-211ENST00000439680 531 ntTSL 412.67□□□□□ -0.381e-10■■■□□ 15
SND1Q7KZF4 CD7-203ENST00000581434 572 ntTSL 321.01■□□□□ 0.955e-7■■■□□ 15
SND1Q7KZF4 CD7-204ENST00000581744 990 ntTSL 218.58■□□□□ 0.565e-7■■■□□ 15
SND1Q7KZF4 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.375e-7■■■□□ 15
SND1Q7KZF4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.046e-7■■■□□ 15
SND1Q7KZF4 MARS-205ENST00000546481 561 ntTSL 323.51■■□□□ 1.356e-7■■■□□ 15
SND1Q7KZF4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.275e-10■■■□□ 15
SND1Q7KZF4 MARS-227ENST00000552007 434 ntTSL 322.22■■□□□ 1.156e-7■■■□□ 15
SND1Q7KZF4 MARS-207ENST00000547062 571 ntTSL 221.23■□□□□ 0.996e-7■■■□□ 15
SND1Q7KZF4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.986e-7■■■□□ 15
SND1Q7KZF4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.986e-7■■■□□ 15
SND1Q7KZF4 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.966e-7■■■□□ 15
SND1Q7KZF4 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.96e-7■■■□□ 15
SND1Q7KZF4 MARS-232ENST00000553162 575 ntTSL 220.61■□□□□ 0.896e-7■■■□□ 15
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SND1Q7KZF4 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.766e-7■■■□□ 15
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SND1Q7KZF4 MARS-223ENST00000551431 559 ntTSL 419.66■□□□□ 0.746e-7■■■□□ 15
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