Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q71RC1 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q71RC1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q71RC1 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q71RC1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q71RC1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q71RC1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q71RC1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q71RC1 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q71RC1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q71RC1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q71RC1 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q71RC1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q71RC1 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q71RC1 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q71RC1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q71RC1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q71RC1 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q71RC1 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q71RC1 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q71RC1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q71RC1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q71RC1 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q71RC1 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q71RC1 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Q71RC1 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q71RC1 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q71RC1 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Q71RC1 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q71RC1 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q71RC1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q71RC1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q71RC1 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q71RC1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q71RC1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q71RC1 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q71RC1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q71RC1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q71RC1 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q71RC1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q71RC1 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q71RC1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q71RC1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q71RC1 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q71RC1 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q71RC1 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q71RC1 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Q71RC1 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q71RC1 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q71RC1 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q71RC1 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q71RC1 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q71RC1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q71RC1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q71RC1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q71RC1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q71RC1 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q71RC1 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q71RC1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q71RC1 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q71RC1 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q71RC1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q71RC1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q71RC1 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q71RC1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q71RC1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q71RC1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q71RC1 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q71RC1 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q71RC1 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q71RC1 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q71RC1 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Q71RC1 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Q71RC1 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q71RC1 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q71RC1 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Q71RC1 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q71RC1 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q71RC1 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Q71RC1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q71RC1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q71RC1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q71RC1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q71RC1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q71RC1 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q71RC1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q71RC1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q71RC1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q71RC1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q71RC1 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q71RC1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q71RC1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q71RC1 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q71RC1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q71RC1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q71RC1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q71RC1 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q71RC1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q71RC1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q71RC1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms