Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW56

ATRAID, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRAIDQ6UW56 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms