Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms