Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms