Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBL2

ZNF628, Zinc finger protein 628, humanhuman

Predictions only

Length 1,059 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF628Q5EBL2 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF628Q5EBL2 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF628Q5EBL2 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF628Q5EBL2 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF628Q5EBL2 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF628Q5EBL2 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF628Q5EBL2 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF628Q5EBL2 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF628Q5EBL2 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF628Q5EBL2 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF628Q5EBL2 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF628Q5EBL2 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF628Q5EBL2 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF628Q5EBL2 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF628Q5EBL2 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF628Q5EBL2 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF628Q5EBL2 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF628Q5EBL2 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF628Q5EBL2 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF628Q5EBL2 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF628Q5EBL2 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF628Q5EBL2 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF628Q5EBL2 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF628Q5EBL2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF628Q5EBL2 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF628Q5EBL2 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF628Q5EBL2 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF628Q5EBL2 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF628Q5EBL2 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF628Q5EBL2 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF628Q5EBL2 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF628Q5EBL2 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF628Q5EBL2 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF628Q5EBL2 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF628Q5EBL2 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF628Q5EBL2 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF628Q5EBL2 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF628Q5EBL2 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF628Q5EBL2 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF628Q5EBL2 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF628Q5EBL2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF628Q5EBL2 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF628Q5EBL2 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF628Q5EBL2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF628Q5EBL2 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF628Q5EBL2 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF628Q5EBL2 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF628Q5EBL2 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF628Q5EBL2 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF628Q5EBL2 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF628Q5EBL2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF628Q5EBL2 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF628Q5EBL2 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF628Q5EBL2 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF628Q5EBL2 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF628Q5EBL2 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF628Q5EBL2 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF628Q5EBL2 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF628Q5EBL2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF628Q5EBL2 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF628Q5EBL2 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF628Q5EBL2 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF628Q5EBL2 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF628Q5EBL2 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF628Q5EBL2 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF628Q5EBL2 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF628Q5EBL2 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF628Q5EBL2 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF628Q5EBL2 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF628Q5EBL2 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF628Q5EBL2 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF628Q5EBL2 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF628Q5EBL2 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF628Q5EBL2 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF628Q5EBL2 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF628Q5EBL2 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF628Q5EBL2 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF628Q5EBL2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF628Q5EBL2 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF628Q5EBL2 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF628Q5EBL2 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF628Q5EBL2 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF628Q5EBL2 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF628Q5EBL2 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF628Q5EBL2 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF628Q5EBL2 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF628Q5EBL2 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF628Q5EBL2 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF628Q5EBL2 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF628Q5EBL2 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF628Q5EBL2 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF628Q5EBL2 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF628Q5EBL2 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF628Q5EBL2 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF628Q5EBL2 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF628Q5EBL2 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF628Q5EBL2 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF628Q5EBL2 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF628Q5EBL2 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF628Q5EBL2 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms