Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms