Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI83

KRTAP24-1, Keratin-associated protein 24-1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP24-1Q3LI83 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRTAP24-1Q3LI83 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KRTAP24-1Q3LI83 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRTAP24-1Q3LI83 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRTAP24-1Q3LI83 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRTAP24-1Q3LI83 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRTAP24-1Q3LI83 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRTAP24-1Q3LI83 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRTAP24-1Q3LI83 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRTAP24-1Q3LI83 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRTAP24-1Q3LI83 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KRTAP24-1Q3LI83 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRTAP24-1Q3LI83 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRTAP24-1Q3LI83 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KRTAP24-1Q3LI83 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KRTAP24-1Q3LI83 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRTAP24-1Q3LI83 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRTAP24-1Q3LI83 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRTAP24-1Q3LI83 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KRTAP24-1Q3LI83 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KRTAP24-1Q3LI83 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRTAP24-1Q3LI83 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRTAP24-1Q3LI83 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRTAP24-1Q3LI83 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRTAP24-1Q3LI83 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KRTAP24-1Q3LI83 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRTAP24-1Q3LI83 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRTAP24-1Q3LI83 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRTAP24-1Q3LI83 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRTAP24-1Q3LI83 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRTAP24-1Q3LI83 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRTAP24-1Q3LI83 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRTAP24-1Q3LI83 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRTAP24-1Q3LI83 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRTAP24-1Q3LI83 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KRTAP24-1Q3LI83 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KRTAP24-1Q3LI83 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KRTAP24-1Q3LI83 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRTAP24-1Q3LI83 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KRTAP24-1Q3LI83 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KRTAP24-1Q3LI83 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRTAP24-1Q3LI83 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRTAP24-1Q3LI83 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRTAP24-1Q3LI83 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRTAP24-1Q3LI83 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KRTAP24-1Q3LI83 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRTAP24-1Q3LI83 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRTAP24-1Q3LI83 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRTAP24-1Q3LI83 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRTAP24-1Q3LI83 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRTAP24-1Q3LI83 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRTAP24-1Q3LI83 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRTAP24-1Q3LI83 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRTAP24-1Q3LI83 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KRTAP24-1Q3LI83 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRTAP24-1Q3LI83 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRTAP24-1Q3LI83 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRTAP24-1Q3LI83 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRTAP24-1Q3LI83 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRTAP24-1Q3LI83 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRTAP24-1Q3LI83 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRTAP24-1Q3LI83 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP24-1Q3LI83 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP24-1Q3LI83 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP24-1Q3LI83 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP24-1Q3LI83 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP24-1Q3LI83 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP24-1Q3LI83 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP24-1Q3LI83 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP24-1Q3LI83 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP24-1Q3LI83 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP24-1Q3LI83 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP24-1Q3LI83 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP24-1Q3LI83 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP24-1Q3LI83 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP24-1Q3LI83 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP24-1Q3LI83 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP24-1Q3LI83 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP24-1Q3LI83 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP24-1Q3LI83 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP24-1Q3LI83 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP24-1Q3LI83 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP24-1Q3LI83 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP24-1Q3LI83 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP24-1Q3LI83 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP24-1Q3LI83 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP24-1Q3LI83 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP24-1Q3LI83 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP24-1Q3LI83 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP24-1Q3LI83 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP24-1Q3LI83 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP24-1Q3LI83 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP24-1Q3LI83 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP24-1Q3LI83 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP24-1Q3LI83 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP24-1Q3LI83 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP24-1Q3LI83 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP24-1Q3LI83 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP24-1Q3LI83 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP24-1Q3LI83 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms