Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI77

KRTAP13-4, Keratin-associated protein 13-4, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-4Q3LI77 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP13-4Q3LI77 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP13-4Q3LI77 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP13-4Q3LI77 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP13-4Q3LI77 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP13-4Q3LI77 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP13-4Q3LI77 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP13-4Q3LI77 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP13-4Q3LI77 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP13-4Q3LI77 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP13-4Q3LI77 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP13-4Q3LI77 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP13-4Q3LI77 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP13-4Q3LI77 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP13-4Q3LI77 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP13-4Q3LI77 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP13-4Q3LI77 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP13-4Q3LI77 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP13-4Q3LI77 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP13-4Q3LI77 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP13-4Q3LI77 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-4Q3LI77 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-4Q3LI77 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-4Q3LI77 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-4Q3LI77 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-4Q3LI77 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-4Q3LI77 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-4Q3LI77 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-4Q3LI77 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-4Q3LI77 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-4Q3LI77 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-4Q3LI77 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-4Q3LI77 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-4Q3LI77 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-4Q3LI77 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-4Q3LI77 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-4Q3LI77 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-4Q3LI77 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-4Q3LI77 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-4Q3LI77 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-4Q3LI77 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-4Q3LI77 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-4Q3LI77 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-4Q3LI77 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-4Q3LI77 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-4Q3LI77 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-4Q3LI77 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-4Q3LI77 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-4Q3LI77 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-4Q3LI77 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-4Q3LI77 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-4Q3LI77 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-4Q3LI77 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-4Q3LI77 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-4Q3LI77 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-4Q3LI77 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-4Q3LI77 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-4Q3LI77 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-4Q3LI77 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-4Q3LI77 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-4Q3LI77 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-4Q3LI77 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-4Q3LI77 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-4Q3LI77 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-4Q3LI77 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-4Q3LI77 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-4Q3LI77 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-4Q3LI77 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-4Q3LI77 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-4Q3LI77 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-4Q3LI77 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-4Q3LI77 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-4Q3LI77 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-4Q3LI77 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-4Q3LI77 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-4Q3LI77 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP13-4Q3LI77 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP13-4Q3LI77 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP13-4Q3LI77 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP13-4Q3LI77 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP13-4Q3LI77 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP13-4Q3LI77 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP13-4Q3LI77 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP13-4Q3LI77 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP13-4Q3LI77 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP13-4Q3LI77 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP13-4Q3LI77 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP13-4Q3LI77 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP13-4Q3LI77 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP13-4Q3LI77 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP13-4Q3LI77 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP13-4Q3LI77 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP13-4Q3LI77 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP13-4Q3LI77 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP13-4Q3LI77 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP13-4Q3LI77 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP13-4Q3LI77 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP13-4Q3LI77 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP13-4Q3LI77 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP13-4Q3LI77 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms