Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms