Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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CYTH1Q15438 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
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CYTH1Q15438 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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CYTH1Q15438 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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CYTH1Q15438 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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CYTH1Q15438 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
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CYTH1Q15438 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
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