Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
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