Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
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