Protein–RNA interactions for Protein: Q14CW9

ATXN7L3, Ataxin-7-like protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN7L3Q14CW9 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATXN7L3Q14CW9 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATXN7L3Q14CW9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATXN7L3Q14CW9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATXN7L3Q14CW9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATXN7L3Q14CW9 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATXN7L3Q14CW9 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ATXN7L3Q14CW9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATXN7L3Q14CW9 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATXN7L3Q14CW9 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATXN7L3Q14CW9 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATXN7L3Q14CW9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATXN7L3Q14CW9 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATXN7L3Q14CW9 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATXN7L3Q14CW9 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATXN7L3Q14CW9 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATXN7L3Q14CW9 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATXN7L3Q14CW9 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATXN7L3Q14CW9 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATXN7L3Q14CW9 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATXN7L3Q14CW9 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATXN7L3Q14CW9 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATXN7L3Q14CW9 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATXN7L3Q14CW9 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATXN7L3Q14CW9 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATXN7L3Q14CW9 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATXN7L3Q14CW9 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATXN7L3Q14CW9 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATXN7L3Q14CW9 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATXN7L3Q14CW9 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATXN7L3Q14CW9 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATXN7L3Q14CW9 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATXN7L3Q14CW9 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATXN7L3Q14CW9 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATXN7L3Q14CW9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATXN7L3Q14CW9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATXN7L3Q14CW9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATXN7L3Q14CW9 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATXN7L3Q14CW9 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATXN7L3Q14CW9 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATXN7L3Q14CW9 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATXN7L3Q14CW9 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATXN7L3Q14CW9 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATXN7L3Q14CW9 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ATXN7L3Q14CW9 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATXN7L3Q14CW9 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ATXN7L3Q14CW9 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATXN7L3Q14CW9 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATXN7L3Q14CW9 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATXN7L3Q14CW9 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATXN7L3Q14CW9 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ATXN7L3Q14CW9 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATXN7L3Q14CW9 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATXN7L3Q14CW9 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATXN7L3Q14CW9 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATXN7L3Q14CW9 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATXN7L3Q14CW9 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATXN7L3Q14CW9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATXN7L3Q14CW9 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATXN7L3Q14CW9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ATXN7L3Q14CW9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ATXN7L3Q14CW9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATXN7L3Q14CW9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATXN7L3Q14CW9 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATXN7L3Q14CW9 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATXN7L3Q14CW9 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ATXN7L3Q14CW9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ATXN7L3Q14CW9 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ATXN7L3Q14CW9 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATXN7L3Q14CW9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATXN7L3Q14CW9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATXN7L3Q14CW9 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATXN7L3Q14CW9 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATXN7L3Q14CW9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATXN7L3Q14CW9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATXN7L3Q14CW9 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATXN7L3Q14CW9 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATXN7L3Q14CW9 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATXN7L3Q14CW9 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATXN7L3Q14CW9 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATXN7L3Q14CW9 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATXN7L3Q14CW9 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATXN7L3Q14CW9 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATXN7L3Q14CW9 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATXN7L3Q14CW9 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATXN7L3Q14CW9 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATXN7L3Q14CW9 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATXN7L3Q14CW9 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATXN7L3Q14CW9 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATXN7L3Q14CW9 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATXN7L3Q14CW9 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATXN7L3Q14CW9 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATXN7L3Q14CW9 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATXN7L3Q14CW9 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATXN7L3Q14CW9 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATXN7L3Q14CW9 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATXN7L3Q14CW9 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATXN7L3Q14CW9 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATXN7L3Q14CW9 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATXN7L3Q14CW9 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms