Protein–RNA interactions for Protein: Q14973

SLC10A1, Sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A1Q14973 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SLC10A1Q14973 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SLC10A1Q14973 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC10A1Q14973 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC10A1Q14973 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC10A1Q14973 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC10A1Q14973 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC10A1Q14973 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC10A1Q14973 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC10A1Q14973 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC10A1Q14973 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC10A1Q14973 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC10A1Q14973 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC10A1Q14973 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC10A1Q14973 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC10A1Q14973 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC10A1Q14973 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC10A1Q14973 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC10A1Q14973 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC10A1Q14973 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC10A1Q14973 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC10A1Q14973 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC10A1Q14973 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC10A1Q14973 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC10A1Q14973 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC10A1Q14973 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC10A1Q14973 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC10A1Q14973 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC10A1Q14973 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC10A1Q14973 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC10A1Q14973 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC10A1Q14973 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC10A1Q14973 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC10A1Q14973 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC10A1Q14973 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC10A1Q14973 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC10A1Q14973 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC10A1Q14973 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC10A1Q14973 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC10A1Q14973 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC10A1Q14973 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC10A1Q14973 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC10A1Q14973 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC10A1Q14973 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC10A1Q14973 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC10A1Q14973 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC10A1Q14973 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC10A1Q14973 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC10A1Q14973 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC10A1Q14973 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC10A1Q14973 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC10A1Q14973 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC10A1Q14973 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC10A1Q14973 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC10A1Q14973 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC10A1Q14973 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC10A1Q14973 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC10A1Q14973 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC10A1Q14973 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC10A1Q14973 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC10A1Q14973 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC10A1Q14973 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC10A1Q14973 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC10A1Q14973 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC10A1Q14973 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms