Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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