Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
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