Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
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