Protein–RNA interactions for Protein: Q13573

SNW1, SNW domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNW1Q13573 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNW1Q13573 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNW1Q13573 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNW1Q13573 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNW1Q13573 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNW1Q13573 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNW1Q13573 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SNW1Q13573 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNW1Q13573 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNW1Q13573 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNW1Q13573 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNW1Q13573 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNW1Q13573 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNW1Q13573 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNW1Q13573 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNW1Q13573 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNW1Q13573 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNW1Q13573 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNW1Q13573 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNW1Q13573 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNW1Q13573 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNW1Q13573 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNW1Q13573 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNW1Q13573 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNW1Q13573 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNW1Q13573 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNW1Q13573 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNW1Q13573 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNW1Q13573 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNW1Q13573 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNW1Q13573 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNW1Q13573 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNW1Q13573 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNW1Q13573 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SNW1Q13573 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNW1Q13573 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNW1Q13573 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNW1Q13573 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNW1Q13573 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNW1Q13573 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNW1Q13573 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNW1Q13573 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNW1Q13573 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNW1Q13573 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNW1Q13573 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNW1Q13573 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNW1Q13573 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SNW1Q13573 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNW1Q13573 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNW1Q13573 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNW1Q13573 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNW1Q13573 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SNW1Q13573 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SNW1Q13573 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNW1Q13573 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNW1Q13573 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNW1Q13573 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SNW1Q13573 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNW1Q13573 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNW1Q13573 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNW1Q13573 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNW1Q13573 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNW1Q13573 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNW1Q13573 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNW1Q13573 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNW1Q13573 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNW1Q13573 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SNW1Q13573 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SNW1Q13573 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNW1Q13573 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNW1Q13573 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNW1Q13573 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNW1Q13573 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNW1Q13573 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNW1Q13573 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNW1Q13573 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNW1Q13573 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNW1Q13573 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNW1Q13573 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNW1Q13573 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNW1Q13573 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNW1Q13573 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNW1Q13573 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNW1Q13573 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNW1Q13573 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNW1Q13573 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNW1Q13573 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNW1Q13573 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SNW1Q13573 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNW1Q13573 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SNW1Q13573 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNW1Q13573 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNW1Q13573 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNW1Q13573 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNW1Q13573 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNW1Q13573 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNW1Q13573 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNW1Q13573 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNW1Q13573 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNW1Q13573 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms