Protein–RNA interactions for Protein: Q13445

TMED1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1Q13445 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms