Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
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