Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.8 ms