Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms