Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms