Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CXCL9Q07325 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CXCL9Q07325 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CXCL9Q07325 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms