Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
ERCC6Q03468 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
ERCC6Q03468 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
ERCC6Q03468 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
ERCC6Q03468 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC34.21■■■■□ 3.07
ERCC6Q03468 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
ERCC6Q03468 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ERCC6Q03468 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
ERCC6Q03468 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ERCC6Q03468 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
ERCC6Q03468 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
ERCC6Q03468 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ERCC6Q03468 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
ERCC6Q03468 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
ERCC6Q03468 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ERCC6Q03468 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ERCC6Q03468 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
ERCC6Q03468 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
ERCC6Q03468 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
ERCC6Q03468 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
ERCC6Q03468 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
ERCC6Q03468 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
ERCC6Q03468 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
ERCC6Q03468 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
ERCC6Q03468 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
ERCC6Q03468 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.2■■■■□ 3.07
ERCC6Q03468 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
ERCC6Q03468 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
ERCC6Q03468 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
ERCC6Q03468 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
ERCC6Q03468 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
ERCC6Q03468 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
ERCC6Q03468 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
ERCC6Q03468 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
ERCC6Q03468 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
ERCC6Q03468 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
ERCC6Q03468 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
ERCC6Q03468 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.06
ERCC6Q03468 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.06
ERCC6Q03468 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
ERCC6Q03468 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ERCC6Q03468 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
ERCC6Q03468 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ERCC6Q03468 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ERCC6Q03468 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
ERCC6Q03468 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
ERCC6Q03468 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
ERCC6Q03468 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
ERCC6Q03468 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
ERCC6Q03468 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
ERCC6Q03468 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
ERCC6Q03468 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
ERCC6Q03468 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
ERCC6Q03468 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
ERCC6Q03468 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
ERCC6Q03468 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
ERCC6Q03468 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
ERCC6Q03468 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC34.18■■■■□ 3.06
ERCC6Q03468 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
ERCC6Q03468 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
ERCC6Q03468 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
ERCC6Q03468 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
ERCC6Q03468 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
ERCC6Q03468 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
ERCC6Q03468 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
ERCC6Q03468 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
ERCC6Q03468 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
ERCC6Q03468 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
ERCC6Q03468 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
ERCC6Q03468 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
ERCC6Q03468 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
ERCC6Q03468 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ERCC6Q03468 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
ERCC6Q03468 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
ERCC6Q03468 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ERCC6Q03468 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
ERCC6Q03468 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ERCC6Q03468 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
ERCC6Q03468 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
ERCC6Q03468 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC34.16■■■■□ 3.06
ERCC6Q03468 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC34.16■■■■□ 3.06
ERCC6Q03468 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
ERCC6Q03468 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ERCC6Q03468 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ERCC6Q03468 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
ERCC6Q03468 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
ERCC6Q03468 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
ERCC6Q03468 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ERCC6Q03468 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
ERCC6Q03468 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
ERCC6Q03468 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
ERCC6Q03468 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
ERCC6Q03468 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
ERCC6Q03468 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ERCC6Q03468 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ERCC6Q03468 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ERCC6Q03468 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ERCC6Q03468 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
ERCC6Q03468 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
ERCC6Q03468 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms