Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAV1Q03135 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAV1Q03135 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAV1Q03135 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAV1Q03135 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAV1Q03135 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CAV1Q03135 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAV1Q03135 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAV1Q03135 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAV1Q03135 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAV1Q03135 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAV1Q03135 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAV1Q03135 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAV1Q03135 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAV1Q03135 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAV1Q03135 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAV1Q03135 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAV1Q03135 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAV1Q03135 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAV1Q03135 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAV1Q03135 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAV1Q03135 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAV1Q03135 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAV1Q03135 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAV1Q03135 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAV1Q03135 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAV1Q03135 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAV1Q03135 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAV1Q03135 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAV1Q03135 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAV1Q03135 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAV1Q03135 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAV1Q03135 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAV1Q03135 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAV1Q03135 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CAV1Q03135 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAV1Q03135 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAV1Q03135 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAV1Q03135 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAV1Q03135 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAV1Q03135 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAV1Q03135 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAV1Q03135 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAV1Q03135 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAV1Q03135 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAV1Q03135 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAV1Q03135 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAV1Q03135 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAV1Q03135 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAV1Q03135 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAV1Q03135 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAV1Q03135 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAV1Q03135 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAV1Q03135 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAV1Q03135 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAV1Q03135 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAV1Q03135 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAV1Q03135 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAV1Q03135 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAV1Q03135 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAV1Q03135 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAV1Q03135 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAV1Q03135 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAV1Q03135 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAV1Q03135 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAV1Q03135 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAV1Q03135 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAV1Q03135 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CAV1Q03135 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAV1Q03135 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAV1Q03135 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAV1Q03135 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAV1Q03135 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAV1Q03135 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAV1Q03135 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAV1Q03135 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAV1Q03135 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAV1Q03135 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAV1Q03135 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAV1Q03135 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAV1Q03135 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms