Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms