Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms