Protein–RNA interactions for Protein: P62745

RHOB, Rho-related GTP-binding protein RhoB, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBP62745 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RHOBP62745 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RHOBP62745 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RHOBP62745 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RHOBP62745 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RHOBP62745 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RHOBP62745 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RHOBP62745 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RHOBP62745 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RHOBP62745 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RHOBP62745 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RHOBP62745 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RHOBP62745 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RHOBP62745 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOBP62745 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOBP62745 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOBP62745 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOBP62745 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOBP62745 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOBP62745 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOBP62745 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOBP62745 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOBP62745 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOBP62745 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOBP62745 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOBP62745 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOBP62745 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOBP62745 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOBP62745 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOBP62745 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOBP62745 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOBP62745 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOBP62745 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOBP62745 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOBP62745 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOBP62745 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOBP62745 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOBP62745 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOBP62745 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOBP62745 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOBP62745 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOBP62745 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOBP62745 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOBP62745 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOBP62745 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOBP62745 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOBP62745 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOBP62745 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOBP62745 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOBP62745 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOBP62745 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOBP62745 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOBP62745 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOBP62745 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOBP62745 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOBP62745 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOBP62745 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOBP62745 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOBP62745 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOBP62745 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOBP62745 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOBP62745 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOBP62745 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOBP62745 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOBP62745 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOBP62745 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOBP62745 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOBP62745 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOBP62745 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOBP62745 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOBP62745 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOBP62745 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOBP62745 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOBP62745 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOBP62745 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOBP62745 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOBP62745 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOBP62745 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOBP62745 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOBP62745 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOBP62745 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOBP62745 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOBP62745 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOBP62745 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOBP62745 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOBP62745 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOBP62745 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOBP62745 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOBP62745 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOBP62745 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOBP62745 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOBP62745 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOBP62745 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOBP62745 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOBP62745 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOBP62745 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOBP62745 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOBP62745 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOBP62745 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOBP62745 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms