Protein–RNA interactions for Protein: P59074

CHMP4BP1, Putative charged multivesicular body protein 4B-like protein CHMP4BP1, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BP1P59074 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms