Protein–RNA interactions for Protein: P56182

RRP1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1P56182 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RRP1P56182 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RRP1P56182 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RRP1P56182 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RRP1P56182 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RRP1P56182 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RRP1P56182 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RRP1P56182 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RRP1P56182 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RRP1P56182 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RRP1P56182 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RRP1P56182 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RRP1P56182 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RRP1P56182 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RRP1P56182 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RRP1P56182 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RRP1P56182 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RRP1P56182 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RRP1P56182 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RRP1P56182 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RRP1P56182 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RRP1P56182 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RRP1P56182 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RRP1P56182 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RRP1P56182 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RRP1P56182 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RRP1P56182 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RRP1P56182 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RRP1P56182 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RRP1P56182 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RRP1P56182 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RRP1P56182 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RRP1P56182 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RRP1P56182 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RRP1P56182 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RRP1P56182 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RRP1P56182 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RRP1P56182 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RRP1P56182 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RRP1P56182 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RRP1P56182 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RRP1P56182 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RRP1P56182 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RRP1P56182 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RRP1P56182 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RRP1P56182 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RRP1P56182 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
RRP1P56182 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RRP1P56182 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RRP1P56182 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RRP1P56182 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RRP1P56182 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RRP1P56182 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RRP1P56182 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RRP1P56182 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RRP1P56182 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RRP1P56182 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RRP1P56182 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RRP1P56182 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RRP1P56182 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RRP1P56182 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RRP1P56182 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RRP1P56182 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RRP1P56182 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RRP1P56182 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RRP1P56182 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RRP1P56182 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RRP1P56182 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RRP1P56182 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RRP1P56182 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RRP1P56182 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RRP1P56182 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RRP1P56182 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RRP1P56182 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RRP1P56182 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RRP1P56182 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRP1P56182 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRP1P56182 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRP1P56182 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRP1P56182 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRP1P56182 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRP1P56182 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RRP1P56182 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRP1P56182 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRP1P56182 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRP1P56182 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRP1P56182 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRP1P56182 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRP1P56182 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRP1P56182 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRP1P56182 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRP1P56182 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRP1P56182 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRP1P56182 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRP1P56182 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRP1P56182 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRP1P56182 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRP1P56182 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRP1P56182 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRP1P56182 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms