Protein–RNA interactions for Protein: P53602

MVD, Diphosphomevalonate decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVDP53602 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MVDP53602 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MVDP53602 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MVDP53602 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MVDP53602 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MVDP53602 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MVDP53602 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MVDP53602 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MVDP53602 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MVDP53602 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
MVDP53602 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
MVDP53602 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
MVDP53602 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MVDP53602 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MVDP53602 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MVDP53602 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MVDP53602 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MVDP53602 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MVDP53602 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MVDP53602 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MVDP53602 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MVDP53602 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MVDP53602 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MVDP53602 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MVDP53602 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
MVDP53602 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
MVDP53602 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MVDP53602 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MVDP53602 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MVDP53602 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MVDP53602 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MVDP53602 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MVDP53602 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MVDP53602 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MVDP53602 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MVDP53602 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MVDP53602 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MVDP53602 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MVDP53602 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MVDP53602 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MVDP53602 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MVDP53602 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MVDP53602 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MVDP53602 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MVDP53602 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MVDP53602 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MVDP53602 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MVDP53602 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MVDP53602 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MVDP53602 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MVDP53602 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MVDP53602 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MVDP53602 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MVDP53602 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MVDP53602 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MVDP53602 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MVDP53602 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MVDP53602 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MVDP53602 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MVDP53602 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MVDP53602 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MVDP53602 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MVDP53602 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MVDP53602 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MVDP53602 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MVDP53602 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MVDP53602 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MVDP53602 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MVDP53602 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MVDP53602 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MVDP53602 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MVDP53602 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MVDP53602 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MVDP53602 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MVDP53602 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MVDP53602 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MVDP53602 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MVDP53602 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MVDP53602 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MVDP53602 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MVDP53602 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MVDP53602 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MVDP53602 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MVDP53602 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MVDP53602 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MVDP53602 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MVDP53602 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MVDP53602 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MVDP53602 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MVDP53602 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MVDP53602 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MVDP53602 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MVDP53602 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MVDP53602 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MVDP53602 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MVDP53602 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MVDP53602 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MVDP53602 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MVDP53602 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MVDP53602 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms