Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms