Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms