Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMB5P28074 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMB5P28074 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMB5P28074 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMB5P28074 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMB5P28074 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMB5P28074 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMB5P28074 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMB5P28074 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMB5P28074 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMB5P28074 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMB5P28074 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMB5P28074 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMB5P28074 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMB5P28074 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMB5P28074 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMB5P28074 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMB5P28074 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMB5P28074 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMB5P28074 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMB5P28074 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMB5P28074 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMB5P28074 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMB5P28074 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMB5P28074 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMB5P28074 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMB5P28074 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMB5P28074 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMB5P28074 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMB5P28074 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMB5P28074 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMB5P28074 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMB5P28074 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMB5P28074 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMB5P28074 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMB5P28074 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMB5P28074 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMB5P28074 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMB5P28074 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMB5P28074 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMB5P28074 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMB5P28074 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMB5P28074 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMB5P28074 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMB5P28074 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMB5P28074 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMB5P28074 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMB5P28074 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMB5P28074 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms