Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC172P0C7W6 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC172P0C7W6 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC172P0C7W6 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC172P0C7W6 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC172P0C7W6 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC172P0C7W6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC172P0C7W6 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC172P0C7W6 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC172P0C7W6 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC172P0C7W6 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC172P0C7W6 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC172P0C7W6 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC172P0C7W6 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC172P0C7W6 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC172P0C7W6 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC172P0C7W6 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC172P0C7W6 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC172P0C7W6 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC172P0C7W6 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC172P0C7W6 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC172P0C7W6 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC172P0C7W6 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC172P0C7W6 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC172P0C7W6 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC172P0C7W6 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC172P0C7W6 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC172P0C7W6 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC172P0C7W6 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC172P0C7W6 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC172P0C7W6 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC172P0C7W6 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC172P0C7W6 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC172P0C7W6 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC172P0C7W6 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC172P0C7W6 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC172P0C7W6 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC172P0C7W6 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC172P0C7W6 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC172P0C7W6 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC172P0C7W6 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC172P0C7W6 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC172P0C7W6 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC172P0C7W6 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC172P0C7W6 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC172P0C7W6 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC172P0C7W6 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC172P0C7W6 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms