Protein–RNA interactions for Protein: P0C1Z6

TFPT, TCF3 fusion partner, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFPTP0C1Z6 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TFPTP0C1Z6 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TFPTP0C1Z6 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TFPTP0C1Z6 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TFPTP0C1Z6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TFPTP0C1Z6 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TFPTP0C1Z6 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TFPTP0C1Z6 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TFPTP0C1Z6 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TFPTP0C1Z6 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TFPTP0C1Z6 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TFPTP0C1Z6 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TFPTP0C1Z6 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TFPTP0C1Z6 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TFPTP0C1Z6 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TFPTP0C1Z6 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TFPTP0C1Z6 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TFPTP0C1Z6 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TFPTP0C1Z6 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TFPTP0C1Z6 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TFPTP0C1Z6 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TFPTP0C1Z6 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TFPTP0C1Z6 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TFPTP0C1Z6 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TFPTP0C1Z6 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TFPTP0C1Z6 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TFPTP0C1Z6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TFPTP0C1Z6 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TFPTP0C1Z6 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TFPTP0C1Z6 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TFPTP0C1Z6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TFPTP0C1Z6 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TFPTP0C1Z6 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TFPTP0C1Z6 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TFPTP0C1Z6 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TFPTP0C1Z6 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TFPTP0C1Z6 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TFPTP0C1Z6 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TFPTP0C1Z6 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TFPTP0C1Z6 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TFPTP0C1Z6 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TFPTP0C1Z6 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TFPTP0C1Z6 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TFPTP0C1Z6 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TFPTP0C1Z6 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TFPTP0C1Z6 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TFPTP0C1Z6 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TFPTP0C1Z6 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFPTP0C1Z6 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFPTP0C1Z6 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFPTP0C1Z6 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFPTP0C1Z6 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFPTP0C1Z6 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFPTP0C1Z6 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFPTP0C1Z6 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFPTP0C1Z6 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFPTP0C1Z6 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFPTP0C1Z6 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFPTP0C1Z6 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFPTP0C1Z6 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFPTP0C1Z6 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFPTP0C1Z6 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFPTP0C1Z6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFPTP0C1Z6 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFPTP0C1Z6 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFPTP0C1Z6 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFPTP0C1Z6 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFPTP0C1Z6 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFPTP0C1Z6 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFPTP0C1Z6 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFPTP0C1Z6 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFPTP0C1Z6 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFPTP0C1Z6 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFPTP0C1Z6 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFPTP0C1Z6 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFPTP0C1Z6 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFPTP0C1Z6 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFPTP0C1Z6 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFPTP0C1Z6 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFPTP0C1Z6 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFPTP0C1Z6 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFPTP0C1Z6 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFPTP0C1Z6 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFPTP0C1Z6 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFPTP0C1Z6 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFPTP0C1Z6 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFPTP0C1Z6 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFPTP0C1Z6 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFPTP0C1Z6 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFPTP0C1Z6 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFPTP0C1Z6 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFPTP0C1Z6 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFPTP0C1Z6 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFPTP0C1Z6 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFPTP0C1Z6 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFPTP0C1Z6 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFPTP0C1Z6 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TFPTP0C1Z6 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFPTP0C1Z6 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFPTP0C1Z6 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms