Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L4

C4A, Complement C4-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4AP0C0L4 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C4AP0C0L4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C4AP0C0L4 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C4AP0C0L4 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C4AP0C0L4 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
C4AP0C0L4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C4AP0C0L4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C4AP0C0L4 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C4AP0C0L4 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C4AP0C0L4 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C4AP0C0L4 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C4AP0C0L4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C4AP0C0L4 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
C4AP0C0L4 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
C4AP0C0L4 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C4AP0C0L4 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
C4AP0C0L4 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
C4AP0C0L4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C4AP0C0L4 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C4AP0C0L4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
C4AP0C0L4 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
C4AP0C0L4 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
C4AP0C0L4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C4AP0C0L4 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
C4AP0C0L4 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
C4AP0C0L4 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C4AP0C0L4 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C4AP0C0L4 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
C4AP0C0L4 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C4AP0C0L4 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C4AP0C0L4 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C4AP0C0L4 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C4AP0C0L4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C4AP0C0L4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
C4AP0C0L4 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C4AP0C0L4 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C4AP0C0L4 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
C4AP0C0L4 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C4AP0C0L4 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C4AP0C0L4 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C4AP0C0L4 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
C4AP0C0L4 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
C4AP0C0L4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C4AP0C0L4 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C4AP0C0L4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C4AP0C0L4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C4AP0C0L4 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
C4AP0C0L4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C4AP0C0L4 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
C4AP0C0L4 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
C4AP0C0L4 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
C4AP0C0L4 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C4AP0C0L4 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
C4AP0C0L4 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
C4AP0C0L4 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
C4AP0C0L4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C4AP0C0L4 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C4AP0C0L4 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
C4AP0C0L4 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
C4AP0C0L4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
C4AP0C0L4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
C4AP0C0L4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
C4AP0C0L4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C4AP0C0L4 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C4AP0C0L4 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C4AP0C0L4 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C4AP0C0L4 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C4AP0C0L4 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C4AP0C0L4 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C4AP0C0L4 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
C4AP0C0L4 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
C4AP0C0L4 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C4AP0C0L4 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
C4AP0C0L4 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C4AP0C0L4 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C4AP0C0L4 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C4AP0C0L4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C4AP0C0L4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C4AP0C0L4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C4AP0C0L4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C4AP0C0L4 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C4AP0C0L4 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C4AP0C0L4 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C4AP0C0L4 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C4AP0C0L4 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C4AP0C0L4 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C4AP0C0L4 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C4AP0C0L4 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C4AP0C0L4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C4AP0C0L4 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C4AP0C0L4 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C4AP0C0L4 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
C4AP0C0L4 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C4AP0C0L4 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C4AP0C0L4 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C4AP0C0L4 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C4AP0C0L4 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C4AP0C0L4 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C4AP0C0L4 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
C4AP0C0L4 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms