Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SGSM2O43147 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SGSM2O43147 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SGSM2O43147 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SGSM2O43147 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SGSM2O43147 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SGSM2O43147 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SGSM2O43147 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SGSM2O43147 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SGSM2O43147 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SGSM2O43147 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SGSM2O43147 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SGSM2O43147 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SGSM2O43147 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SGSM2O43147 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SGSM2O43147 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SGSM2O43147 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SGSM2O43147 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SGSM2O43147 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SGSM2O43147 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SGSM2O43147 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SGSM2O43147 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SGSM2O43147 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SGSM2O43147 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SGSM2O43147 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SGSM2O43147 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SGSM2O43147 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SGSM2O43147 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SGSM2O43147 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SGSM2O43147 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SGSM2O43147 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SGSM2O43147 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SGSM2O43147 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SGSM2O43147 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SGSM2O43147 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SGSM2O43147 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SGSM2O43147 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SGSM2O43147 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SGSM2O43147 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SGSM2O43147 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SGSM2O43147 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SGSM2O43147 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SGSM2O43147 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SGSM2O43147 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SGSM2O43147 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGSM2O43147 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGSM2O43147 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGSM2O43147 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGSM2O43147 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGSM2O43147 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGSM2O43147 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGSM2O43147 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGSM2O43147 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGSM2O43147 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGSM2O43147 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGSM2O43147 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGSM2O43147 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SGSM2O43147 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SGSM2O43147 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGSM2O43147 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGSM2O43147 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGSM2O43147 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGSM2O43147 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGSM2O43147 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGSM2O43147 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGSM2O43147 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGSM2O43147 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGSM2O43147 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGSM2O43147 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGSM2O43147 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGSM2O43147 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SGSM2O43147 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SGSM2O43147 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SGSM2O43147 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SGSM2O43147 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SGSM2O43147 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SGSM2O43147 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SGSM2O43147 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SGSM2O43147 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SGSM2O43147 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SGSM2O43147 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SGSM2O43147 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SGSM2O43147 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SGSM2O43147 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SGSM2O43147 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SGSM2O43147 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SGSM2O43147 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SGSM2O43147 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SGSM2O43147 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SGSM2O43147 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SGSM2O43147 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SGSM2O43147 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SGSM2O43147 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SGSM2O43147 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SGSM2O43147 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SGSM2O43147 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SGSM2O43147 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SGSM2O43147 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SGSM2O43147 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SGSM2O43147 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms