Protein–RNA interactions for Protein: O00193

SMAP, Small acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAPO00193 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMAPO00193 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMAPO00193 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMAPO00193 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMAPO00193 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMAPO00193 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMAPO00193 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMAPO00193 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMAPO00193 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMAPO00193 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMAPO00193 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMAPO00193 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMAPO00193 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMAPO00193 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMAPO00193 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMAPO00193 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMAPO00193 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMAPO00193 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMAPO00193 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMAPO00193 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMAPO00193 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMAPO00193 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMAPO00193 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMAPO00193 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMAPO00193 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMAPO00193 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMAPO00193 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMAPO00193 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMAPO00193 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMAPO00193 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMAPO00193 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMAPO00193 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMAPO00193 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMAPO00193 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMAPO00193 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMAPO00193 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMAPO00193 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMAPO00193 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMAPO00193 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMAPO00193 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMAPO00193 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMAPO00193 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMAPO00193 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMAPO00193 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMAPO00193 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMAPO00193 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMAPO00193 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMAPO00193 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMAPO00193 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMAPO00193 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMAPO00193 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMAPO00193 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMAPO00193 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMAPO00193 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMAPO00193 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMAPO00193 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMAPO00193 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMAPO00193 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMAPO00193 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMAPO00193 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMAPO00193 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMAPO00193 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMAPO00193 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMAPO00193 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMAPO00193 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMAPO00193 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMAPO00193 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMAPO00193 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMAPO00193 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMAPO00193 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SMAPO00193 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMAPO00193 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMAPO00193 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMAPO00193 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMAPO00193 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SMAPO00193 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMAPO00193 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SMAPO00193 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SMAPO00193 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMAPO00193 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMAPO00193 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMAPO00193 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMAPO00193 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMAPO00193 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMAPO00193 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMAPO00193 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMAPO00193 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMAPO00193 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMAPO00193 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMAPO00193 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMAPO00193 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMAPO00193 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMAPO00193 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMAPO00193 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMAPO00193 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMAPO00193 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMAPO00193 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMAPO00193 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMAPO00193 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMAPO00193 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
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