Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms