Protein–RNA interactions for Protein: A2RUB6

CCDC66, Coiled-coil domain-containing protein 66, humanhuman

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC66A2RUB6 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC66A2RUB6 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC66A2RUB6 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC66A2RUB6 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC66A2RUB6 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC66A2RUB6 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC66A2RUB6 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC66A2RUB6 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC66A2RUB6 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC66A2RUB6 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC66A2RUB6 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC66A2RUB6 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC66A2RUB6 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC66A2RUB6 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC66A2RUB6 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC66A2RUB6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC66A2RUB6 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC66A2RUB6 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC66A2RUB6 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC66A2RUB6 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC66A2RUB6 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC66A2RUB6 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC66A2RUB6 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC66A2RUB6 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC66A2RUB6 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC66A2RUB6 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC66A2RUB6 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC66A2RUB6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC66A2RUB6 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC66A2RUB6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC66A2RUB6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC66A2RUB6 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC66A2RUB6 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC66A2RUB6 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC66A2RUB6 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC66A2RUB6 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC66A2RUB6 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC66A2RUB6 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC66A2RUB6 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC66A2RUB6 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC66A2RUB6 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC66A2RUB6 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC66A2RUB6 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC66A2RUB6 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC66A2RUB6 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC66A2RUB6 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC66A2RUB6 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC66A2RUB6 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC66A2RUB6 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC66A2RUB6 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC66A2RUB6 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC66A2RUB6 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC66A2RUB6 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC66A2RUB6 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC66A2RUB6 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC66A2RUB6 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC66A2RUB6 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC66A2RUB6 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC66A2RUB6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC66A2RUB6 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC66A2RUB6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC66A2RUB6 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC66A2RUB6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC66A2RUB6 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC66A2RUB6 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC66A2RUB6 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC66A2RUB6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC66A2RUB6 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC66A2RUB6 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC66A2RUB6 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC66A2RUB6 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC66A2RUB6 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC66A2RUB6 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC66A2RUB6 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC66A2RUB6 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC66A2RUB6 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC66A2RUB6 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC66A2RUB6 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC66A2RUB6 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC66A2RUB6 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC66A2RUB6 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC66A2RUB6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC66A2RUB6 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC66A2RUB6 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC66A2RUB6 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC66A2RUB6 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC66A2RUB6 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC66A2RUB6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC66A2RUB6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC66A2RUB6 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC66A2RUB6 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC66A2RUB6 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC66A2RUB6 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC66A2RUB6 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC66A2RUB6 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC66A2RUB6 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC66A2RUB6 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC66A2RUB6 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC66A2RUB6 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC66A2RUB6 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms